Стандартным - свободен, красным - занят, синим - срочно нужен, подчёркнут - будет в течение игры убит.
Конохагакурэ:
Uzumaki Naruto
Haruno Sakura
Hatake Kakashi
Sai
Yamato
Nara Shikamaru
Yamanako Ino
Akimichi Chodji
Sarutobi Asuma
Hjuga Hinata
Inudzuka Kiba
Aburame Shino
Uhi Kurenai
Maito Gai
Ten Ten
Sarutobi Konohamaru
Rock Lee
Hjuga Nedji
Tsunade
Jiraiya
Shizune
Genma
Morino Ibiki
Umino Iruka
Ibis
Mitarashi Anko
Сунагакурэ:
Gaara no Sobaku
Temari no Sobaku
Kankuro no Sobaku
Matsuri
Baki
Неканонические персонажи, устраивающие заговор против Кадзэкагэ
Отогакурэ:
Yakushi Kabuto
Ketzueki Ksilya
Команда "Ястреб":
Uchiha Sasuke
Karin
Juugo
Suigetsu
Киригакурэ:
Неканонические персонажи
Акацуки:
Uchiha Madara (Tobi)
Pein
Konan
Uchiha Itachi
Hoshikage Kisame
Zetsu
Hidan
Deidara
Kakuzu